Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem35bQ3U0Y2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms