Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms