Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc9Q3U0M1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms