Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hace1Q3U0D9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms