Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms