Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calr4Q3TQS0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calr4Q3TQS0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms