Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eepd1Q3TGW2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms