Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Patl1Q3TC46 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Patl1Q3TC46 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms