Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prr27Q3SYJ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms