Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc2Q3SXD3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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