Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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