Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rhox4dQ2MDG0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms