Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fam178bQ24JP3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms