Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd11Q1RNF8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms