Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne9Q1RLL3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms