Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Myo3bQ1EG27 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms