Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tdrd9Q14BI7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tdrd9Q14BI7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms