Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ptchd1Q14B62 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ptchd1Q14B62 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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