Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rpusd2Q149F1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rpusd2Q149F1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Rpusd2Q149F1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Rpusd2Q149F1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpusd2Q149F1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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