Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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VgfQ0VGU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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VgfQ0VGU4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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VgfQ0VGU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VgfQ0VGU4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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VgfQ0VGU4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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VgfQ0VGU4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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VgfQ0VGU4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms