Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtel1Q0VGM9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtel1Q0VGM9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms