Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cpne7Q0VE82 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms