Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
StumQ0VBF8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms