Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms