Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntnap5bQ0V8T8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms