Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps8Q0P5W1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms