Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc45a4Q0P5V9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms