Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn2bQ0KL01 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms