Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc4Q08624 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms