Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms