Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tff1Q08423 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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