Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gata4Q08369 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms