Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calb2Q08331 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms