Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms