Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms