Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPINDOCQ05AH6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms