Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms