Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col6a1Q04857 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col6a1Q04857 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms