Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smpd1Q04519 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms