Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelaQ04207 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RelaQ04207 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RelaQ04207 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms