Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnb1Q03717 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms