Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tff2Q03404 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms