Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Thbs2Q03350 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs2Q03350 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms