Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddr1Q03146 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms