Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fgfr4Q03142 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fgfr4Q03142 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms