Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cacna1sQ02789 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms