Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms