Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnb1Q02248 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnb1Q02248 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnb1Q02248 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnb1Q02248 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnb1Q02248 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnnb1Q02248 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctnnb1Q02248 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms