Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcqQ02111 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms