Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba1Q02053 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba1Q02053 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms